📰 Aujourd'hui, on vous racconte comment soumettre des données de séquençage à la plateforme GEO :
https://bioinfo-fr.net/chronique-dune-soumission-de-donnees-a-geo
#bioinfofr #data #ngs #ncbi

🙌 Halfway through #BioHackEU24!
This morning, all #BioHackEU24 projects will present their 🎯 project goals and challenges they’ve encountered and seek expertise from participants.

💡 Looking forward to seeing some cross-project collaborations!

Pleased to announce our QC tool for @nanopore sequencers #ToulligQC is available as a @nf_core module 🎉
Implemented in Nextflow, users can modulate ToulligQC to their need!

Excited to announce that our QC tool for #Nanopore sequencers #ToulligQC is now available as an EPI2ME-compatible workflow! 🎉🎉
The EPI2ME Desktop application is easy to use and allows users of any skill level to run their bioinformatic analyses!
Go check it out on our github https://lnkd.in/eQPQbmST and EPI2ME Labs https://lnkd.in/e26Bq44A

New study reshapes our understanding of P-bodies as active participants in RNA regulation, not just storage! We collaborated with the laboratoire de Biologie du Développement from @Sorbonne Université by constructing the libraries and performing #illumina sequencing from human cell lines 🧬 🔬
https://doi.org/10.1101/2024.04.16.589748

How do tardigrades survive ionizing radiation? With our collaborators from AVIV at MNHN, we uncovered DNA repair mechanisms in tardigrades by combining #illumina and #nanopore sequencing on 3 species of tardigrade.
https://doi.org/10.7554/eLife.92621.3

New transcriptomic study demonstrates Decitabine as potential antiviral compound against equine rhinopneumonitis! With our collaborators BioTargen, we performed #illumina sequencing and RNA-seq analysis from horse samples.
https://doi.org/10.3390/v16050746

Exciting new research reveals fasting's impact on the blood-brain barrier! With our collaborators from Université Paris Cité Médicine, we performed #illumina sequencing and RNA-seq analysis from samples of rats brain cells.
https://doi.org/10.1186/s12987-024-00526-8

Depuis 2017, @centralesupelec, l’@ENS_ParisSaclay et l’@UnivParisSaclay ont acheté et hébergé au @cnrs une machine de calcul. Une manière de réduire l’empreinte environnementale et les coûts financiers des datacentres en favorisant les synergies.
https://www.cnrs.fr/fr/actualite/saclay-mutualiser-les-machines-de-calcul-pour-aller-plus-loin-ensemble

📣 Cette semaine, Ista, nouvel auteur du blog, nous fait une introduction à la théorie des graphes. Ça ne fait pas mal à la tête, ni de nœuds dans le cerveau, promis !
https://bioinfo-fr.net/theorie-des-graphes-intro
#bioinfofr #stem #graph #reseaux

📣 Comment faire des genomic tracks qualité publication dans R ? On vous montre comment y arriver avec le paquet Gviz :
https://bioinfo-fr.net/r-representer-des-genomic-tracks-avec-gviz
#bioinfofr #bioinformatique #stem #genomics #visualization

@jobim2024 je suis peut-être pas là mais j'ai quasi le look
...
Oui je suis écolo, j'ai même traficoté une recharge pour ne pas jeter

Marre des posters ? Allez vous détendre avec notre super borne pong disponible à l'accueil 👍 #JOBIM2024

Vous embauchez ? Vous cherchez un emploi ? Pourquoi ne pas faire un tour dans notre coin "offre d'emplois" situé à l'entrée du hall ? #JOBIM2024

📣 Les bioinformations n°38 sont là ! Toute l'actu des réseaux de bioinformatique français en une newsletter trimestrielle :
https://bioinfo-fr.net/les-bioinformations-n38-sont-la
#bioinfofr #SFBI #JeBIF #SFBI #MERIT #GDRbim

So excited ! second run in #RNAdirect with the new
#nanopore R004 flowcells 🎉 1st run yielded 1,6M reads with median quality >Q20. 2nd run : 8.7M, still running…

This is it: my last day working for INRAE 🤯
Can't thank enough all the nice people I've been working with for these last years at BIPAA! We'll surely meet again though, I'm keeping the same office and starting officially at CNRS / @genouest on monday 🎉

New #RNAseq study with our collaborators from PhyMA reveals how T3 and T4 impact gene expression in Xenopus laevis, shedding light on cell cycle regulation and immune system effects. We constructed the library and performed #illumina sequencing.
https://doi.org/10.3389/fendo.2024.1360188

#recrutement #IFB #noemi #mobilite

👍 Merci de diffuser cette annonce

📣 Envie de nous rejoindre à l'IFB ? Déjà titulaire ou CDI #CNRS
@cnrs
ou fonction publique ?

Un poste de gestion est ouvert à la mobilité !
👉Assistant-e en gestion administrative et financière

📅 date limite : 02/06/2024

https://emploi.cnrs.fr/Offres/MOBINT/UAR3601-MOBINT-Z53031/Default.aspx

New study challenges classic view of autonomic innervation! Using #scRNAseq with our collaborators at IBENS, we uncover distinct neuron classes reshaping understanding of pelvic organ control. We constructed the library and performed single-cell sequencing using #illumina.
https://doi.org/10.7554/eLife.91576.3